Bu bölümde, mikrobiyota ve yoğun bakım uygulamaları arasındaki ilişki incelenmektedir. Modern tıp uygulamalarıyla birlikte, insan vücudundaki bakterilerin eradikasyonu üzerine yoğun çaba harcanmıştır. Ancak, son yıllarda vücudumuzdaki faydalı mikroorganizmaların önemi anlaşılmış ve bu mikroorganizmaların korunması ve hastalıkların tedavisinde kullanılmasıyla ilgili çalışmalar artmıştır. Mikrobiyom, bir organ sisteminde yerleşen tüm organizmaları ifade ederken, mikrobiyota ise bu organizmaların genomlarını ifade etmektedir. İnsan mikrobiyomu bakteri, virüs, mantar, arkea ve tek hücreli ökaryotlardan oluşur ve insan hücresi sayısıyla hemen hemen eşittir. Mikrobiyotanın dengesindeki bozulma birçok hastalığın oluşmasında etkilidir. Yoğun bakım hastalarında ise kritik hastalık durumu mikrobiyomun kompozisyonunu ve çeşitliliğini etkileyerek disbiyozis adı verilen duruma neden olur. Bu durumun nedenleri arasında beslenme bozukluğu, opioid kullanımı, antibiyotik kullanımı gibi faktörler yer almaktadır. Yoğun bakım hastalarının mikrobiyota kompozisyonunun sağlıklı bireylere göre farklı olduğu ve yoğun bakıma yatıştan sonra mikrobiyom çeşitliliğinin azaldığı gözlemlenmiştir.(AI)