Gıda Fermantasyonlarındaki Mikrobiyal Floranın Araştırılmasına Yönelik Nükleik Asit Bazlı Yaklaşımlar
Anahtar Kelimeler
Fermantasyon, en sık kullanılan gıda muhafaza yöntemlerinden
biri olmasının yanı sıra insan sağlığı için de faydalı bir işlemdir. Gıdaların
fermantasyonu sırasında bazı mikroorganizmalar önemli bir rol oynar. Mikrobiyal
çeşitliliği araştırmak için kullanılan moleküler yöntemler, nükleik asit bazlı
analizleri kapsamaktadır. Bu yöntemler için, temel olarak; PCR amplifikasyonu,
enzimatik kısıtlama ve elektroforetik teknikleri (T-RFLP-Terminal Kısıtlama
Parçası Uzunluğu Polimorfizmi, DGGE-Denatürasyon Jel GradyanElektroforezi,
TGGE-Sıcaklık Gradyan Jel Elektroforezi) gibi analiz metodları kullanılır. Bu
yöntemler, çok az sayıda dizi okuması üreterek belirli bir örnekteki mikrobiyal
DNA içeriğinin kapsamlı bir tanımını sağlamaktadır. Bu çalışmada, fermantasyonun gıda kalitesini ve ekoloji
dinamiğini iyileştirmek için nükleik asit bazlı yaklaşımlardaki en son
kullanılan yöntemlerin uygulamaları incelenmiştir. Gıda fermantasyonundan
sorumlu mikroorganizmaları teşhis etmek için moleküler yöntemler kullanılarak
mikroorganizmaları analiz etme yöntemleri ve burada kullanılan nükleik asit
bazlı yöntemler incelenmiş ve yeni nesil dizileme teknikler ve yapılan
çalışmalar hakkında bilgi verilmiştir. Çalışma sonucunda nükleik asit bazlı uygulamalarda floranın
güvenilir bir görünümünü elde etmek için ekstraksiyon ve PCR
tekrarlanabilirliğinin sağlanması, bir ekosistemdeki mikrobiyal özelliğin
tespiti için eşzamanlı bir şekilde farklı çalışmaların aynı ekosistemde
tamamlanması, fermente gıdaların artık fonksiyonel metagenomik veya
meta-transkriptomik yöntemlerle ele alınması önerilmektedir.
Kitap Adı:
Biyosistem Mühendisliği V
Atıf Sayısı :
