Mikrobiota, vücudumuzda yaşayan ve bağışıklık sistemi ve metabolizmamıza katkıda bulunan mikroorganizmaların topluluğudur. Bu mikroorganizmalar genellikle gastrointestinal sistemde bulunur. İnsan vücudunda 1014 mikroorganizma bulunur ve bu mikroorganizmaların genom çeşitliliği insan genomuna göre çok daha zengindir. Barsak florası, kişiden kişiye farklılık gösterir ve yaşam şartları ve yaşlanma ile değişebilir. Barsak mikrobiotası, gastrointestinal sistemin sağlığı, patojenlere karşı koruma, besin metabolizması ve vitamin sentezi gibi önemli roller üstlenir. Ayrıca, bazı hastalıklara karşı koruyucu olduğu da kanıtlanmıştır. Mikrobiotanın ve bağışıklık sisteminin gelişimini etkileyen kritik bir dönem, hayatın ilk 1000 günüdür. Doğum şekli ve beslenme şekli, mikrobiota içeriğini etkileyen faktörlerdir. Vajinal yolla doğan bebeklerin barsak florası, annenin vajen florasına benzerken, sezaryen ile doğan bebeklerinki deri mikrobiotasına benzer. Anne sütü veya formül mama ile beslenme de mikrobiota içeriğini etkiler. Anne sütü, yeni mikrobiyal komuniteleri indükler ve büyümeyi uyaran oligosakkaritler içerir. Mikrobiota, immun sistemin gelişiminde önemli bir rol oynar.(AI)