Hipotalamus, beyinde bulunan ve otonom sistem ile endokrin sistemi birbirine entegre ederek kontrolünü sağlayan bir bölümdür. Vücutta istem dışı gelişen olayların dengeli bir şekilde sürdürülmesinde önemli bir rol oynar. Hipotalamus, termoregülasyon, vücut sıvı dengesi, açlık-tokluk hissi, seksüel davranış ve duygulanımların düzenlenmesi gibi önemli fonksiyonları yerine getirir. Hipotalamusun histolojik yapısı, diencephalon bölümünde yer alır ve thalamus, metathalamus, epithalamus, subthalamus ve hipotalamus alt bölümlerinden oluşur. Hipotalamus, hipofiz bezinin kontrolünü sağlar ve hipofizden salgılanan hormonların bir kısmı organlara direkt etki gösterirken bir kısmı endokrin bezlerin hormon salgılamasını düzenler. Bu nedenle hipotalamus ve hipofiz bezine birlikte hipotalamo-hipofizer sistem denir. Hipotalamusun klinik ilişkisi, bu bölgenin hastalıkları ve bu hastalıkların nöroendokrin sistem üzerindeki etkilerini içerir. Epifiz bezinin de hipotalamus ile ilişkisi vardır ve epifiz hücreleri melatonin hormonu salgılar. Hipotalamus ve hipofiz bezinin fonksiyonları, vücudun hormonal aktivitesini düzenler ve birçok geri besleme mekanizmasının düzenlenmesinde merkezi bir rol oynar.(AI)