Bu bölümde, göz enfeksiyonlarından şüphelenilen tüm vakalarda göz örneklerinin alınması gerektiği belirtilmektedir. Örnekler mikrobiyal kontaminasyonu önlemek için aseptik olarak toplanmalıdır. Yöntem ve tercih edilen klinik örnek, klinik tanıya göre seçilmelidir. Göz fungal enfeksiyonlarının tanısı için kullanılan örnekler tablo 6.1'de listelenmiştir. Örneğin, orbital lezyonlarda biyopsi örnekleri, irinli materyal aspirasyonu ve serolojik incelemeler için serum kullanılabilir. Blefarit ve göz kapağı lezyonlarında pamuklu çubuklar ve göz kapağı biyopsi örnekleri kullanılabilir. Dacryoadenitis için gözyaşı bezi biyopsi örnekleri, dacryocanaliculitis için irinli materyal, dacryocystitis için gözyaşı kesesi materyali, konjonktivit için sıyrık lezyonu ve konjonktival biyopsi örneği, keratit için göz kapağı ve konjonktiva sürüntüleri, korneal kazıntılar ve biyopsi örnekleri kullanılabilir. Kontakt lens ilişkili keratit için kontakt lensler, lens kılıfları ve lens solüsyonları kullanılabilir. Scleritis durumunda, konjonktivit veya keratit ile aynı örnekler kullanılabilir. Endoftalmit durumunda, göz travmasını takiben birçok farklı mikrop göze girebilir ve post-travmatik ekzojen endoftalmitise neden olabilir. Endojen fungal endoftalmit, fungemi sonucu oluşabilir ve vitreus ve/veya sulu kültürler ve kan kültürleri ile teşhis edilebilir. Hem sulu hem de vitreus örnekleri oftalmolog tarafından alınmalıdır. Ön kamara sıvısı bir iğne kullanılarak limbus yoluyla aspirasyon yoluyla alınabilir. Vitreus örnekleri pars plana yoluyla elde edilir. İğne biyopsisi sonuçsuz kalırsa, hastanın genel durumuna izin veriyorsa vitreus biyopsisi veya vitrektomi ile örnekler alınmalıdır. İlerleyici veya şiddetli vitritis durumunda, mikrobiyolojik çalışma için hem sulu hem de vitreus kültürleri alınmalıdır. Ön kamara sıvısı sürekli olarak yenilenen 0.3 ml hacimli bir sıvıdır. Vitreus, yenilenmeyen 4 ml hacminde bir jel gibidir. Oftalmolog tarafından iğne aspirasyonu ile 0.1 ml sulu örnekler veya 0.2 ila 0.3 ml vitreus örnekleri kültür için alınabilir. Ön kamara ve vitreus aspirasyonları çoğu vakada toplanır. Alternatif olarak, bazı durumlarda vitreusun tamamı cerrahi olarak vitrektomi yoluyla çıkarılabilir.(AI)